Cette curieuse saison voit la disparition de Daniel Jackson: il meurt, enfin il 'monte' (en quoi s'est il transformé ? mystère et bdg). C'est donc Jonas, un scientifique un peu rebelle de la planète que Daniel a sauvé qui le remplace (il ne durera que cette saison...). Il le fait plus qu'honorablement, O'neill surmonte son aversion pour lui et SG1 continue son travail. Daniel Jackson revient d'ailleurs épisodiquement dans des rêves, des flash backs...
Cette saison est formidable car elle comporte peu d'épisodes isolés, la plupart faisant avancer l'intrigue de la guerre contre les Goa'uld et les réplicateurs (qui gagne en intensité) et rapproche entre eux les alliés Tok'ra, humains, Ases et autres. L'action décolle réellement, les humains ont mis le grappin sur suffisament de technologie pour se payer des chasseurs spatiaux, et même un vaisseau géant, le Prométhée. Beaucoup d'épisodes se passent donc dans l'espace et rappellent furieusement des Star Trek (Voyager ou DS9), il y a d'ailleurs beaucoup de références qui raviront les trekkies comme moi...
La nouveauté de la saison est la montée en puissance du terrible Anubis, le Goa'uld qui ressemble à l'empereur de Star Wars. Son arrivée est un peu téléphonée (que faisait il jusque là ?) mais il est vraiment impressionnant. Il peine d'ailleurs à soumettre les autres Goa'uld qui sont plutôt perso. Le sommet de la saison est la capture et la libération de Thor avec l'aide de SG1.
Des heures de bonheur. Et bravo aux acteurs qui jouent Teal'c et le major Carter, ils réussissent à se renouveler et à montrer de nouvelles facettes de leur personnages après 6 ans de longévité et ce n'est pas fini.