Ce livre est une pure merveille d'écriture. L'histoire est peu banale, et superbement racontée. On s'attache vite à cet être plein de simplicité et de naïveté déconcertante qu'est Charlie. A travers ses yeux, l'éveil intellectuel qu'il va connaître prend la forme d'un magnifique voyage initiatique. Charlie découvre un monde dont il avait toujours été exclus, la reconnaissance sociale, les rapports à autrui et même l'amour d'une femme sont autant de sentiments qui lui étaient inconnus jusqu'alors. L'étendue de ses capacités s'accroît en même temps que son intelligence, on s'en rends dailleurs très bien compte lorsque l'on compare l'écriture enfantine et pleine de fautes d'orthographe d'un Charlie avant traitement, avec celle pleine d'aisance et de perspicacité d'un Charlie après traitement.
L'intelligence de Charlie décuple tellement qu'il finit par devenir un véritable génie avec lequel il est difficile de parler sans se sentir bête à son tour. Et la chute en est d'autant plus douloureuse quand Algernon, la souris test du traitement voit ses capacités s'amenuiser peu à peu signifiant à Charlie le long déclin qui l'attend.